Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtsfQ9R013 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms