Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm4Q9QXA5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm4Q9QXA5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms