Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Edf1Q9JMG1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Edf1Q9JMG1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms