Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
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Col5a3Q9JLI2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Col5a3Q9JLI2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Col5a3Q9JLI2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col5a3Q9JLI2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Col5a3Q9JLI2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Col5a3Q9JLI2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col5a3Q9JLI2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Col5a3Q9JLI2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Col5a3Q9JLI2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col5a3Q9JLI2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col5a3Q9JLI2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col5a3Q9JLI2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col5a3Q9JLI2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col5a3Q9JLI2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col5a3Q9JLI2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col5a3Q9JLI2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col5a3Q9JLI2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col5a3Q9JLI2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col5a3Q9JLI2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Col5a3Q9JLI2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col5a3Q9JLI2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col5a3Q9JLI2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col5a3Q9JLI2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col5a3Q9JLI2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms