Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx20Q9JJY4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx20Q9JJY4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx20Q9JJY4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112 ms