Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms