Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bco1Q9JJS6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Bco1Q9JJS6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bco1Q9JJS6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bco1Q9JJS6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bco1Q9JJS6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bco1Q9JJS6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bco1Q9JJS6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bco1Q9JJS6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bco1Q9JJS6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bco1Q9JJS6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Bco1Q9JJS6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bco1Q9JJS6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Bco1Q9JJS6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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