Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms