Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snap29Q9ERB0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snap29Q9ERB0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms