Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx12Q9ER00 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms