Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r29Q9EQ41 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r29Q9EQ41 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms