Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Tlr1Q9EPQ1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlr1Q9EPQ1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
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Tlr1Q9EPQ1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
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Tlr1Q9EPQ1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Tlr1Q9EPQ1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Tlr1Q9EPQ1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Tlr1Q9EPQ1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlr1Q9EPQ1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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