Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc46a3Q9DC26 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms