Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Alkbh4Q9D8F1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms