Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp2c55Q9D816 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp2c55Q9D816 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cyp2c55Q9D816 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cyp2c55Q9D816 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp2c55Q9D816 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp2c55Q9D816 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp2c55Q9D816 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp2c55Q9D816 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp2c55Q9D816 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp2c55Q9D816 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp2c55Q9D816 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp2c55Q9D816 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp2c55Q9D816 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp2c55Q9D816 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp2c55Q9D816 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp2c55Q9D816 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp2c55Q9D816 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp2c55Q9D816 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp2c55Q9D816 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp2c55Q9D816 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms