Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp5Q9D387 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp5Q9D387 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms