Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q9D1K7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q9D1K7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D1K7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D1K7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1K7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1K7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1K7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D1K7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D1K7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms