Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc17Q9CXD9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc17Q9CXD9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc17Q9CXD9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc17Q9CXD9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc17Q9CXD9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc17Q9CXD9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc17Q9CXD9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc17Q9CXD9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc17Q9CXD9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc17Q9CXD9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc17Q9CXD9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc17Q9CXD9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrc17Q9CXD9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrc17Q9CXD9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrc17Q9CXD9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrc17Q9CXD9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc17Q9CXD9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc17Q9CXD9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc17Q9CXD9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc17Q9CXD9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc17Q9CXD9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc17Q9CXD9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc17Q9CXD9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc17Q9CXD9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc17Q9CXD9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc17Q9CXD9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms