Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prkrip1Q9CWV6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms