Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcf2Q99LE6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms