Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf144aQ925F3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf144aQ925F3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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