Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lims2Q91XD2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lims2Q91XD2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lims2Q91XD2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lims2Q91XD2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lims2Q91XD2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lims2Q91XD2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lims2Q91XD2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lims2Q91XD2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lims2Q91XD2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lims2Q91XD2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lims2Q91XD2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lims2Q91XD2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lims2Q91XD2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lims2Q91XD2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lims2Q91XD2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lims2Q91XD2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lims2Q91XD2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lims2Q91XD2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lims2Q91XD2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lims2Q91XD2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lims2Q91XD2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lims2Q91XD2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lims2Q91XD2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lims2Q91XD2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lims2Q91XD2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lims2Q91XD2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lims2Q91XD2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lims2Q91XD2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lims2Q91XD2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lims2Q91XD2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lims2Q91XD2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lims2Q91XD2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lims2Q91XD2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lims2Q91XD2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lims2Q91XD2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lims2Q91XD2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lims2Q91XD2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lims2Q91XD2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lims2Q91XD2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lims2Q91XD2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lims2Q91XD2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lims2Q91XD2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lims2Q91XD2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lims2Q91XD2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lims2Q91XD2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lims2Q91XD2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lims2Q91XD2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lims2Q91XD2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lims2Q91XD2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lims2Q91XD2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lims2Q91XD2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lims2Q91XD2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.1 ms