Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rassf9Q8K342 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rassf9Q8K342 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms