Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Shtn1Q8K2Q9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Shtn1Q8K2Q9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shtn1Q8K2Q9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Shtn1Q8K2Q9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Shtn1Q8K2Q9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Shtn1Q8K2Q9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shtn1Q8K2Q9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shtn1Q8K2Q9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Shtn1Q8K2Q9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shtn1Q8K2Q9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shtn1Q8K2Q9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shtn1Q8K2Q9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shtn1Q8K2Q9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shtn1Q8K2Q9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shtn1Q8K2Q9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shtn1Q8K2Q9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Shtn1Q8K2Q9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shtn1Q8K2Q9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shtn1Q8K2Q9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shtn1Q8K2Q9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shtn1Q8K2Q9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shtn1Q8K2Q9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Shtn1Q8K2Q9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shtn1Q8K2Q9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shtn1Q8K2Q9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shtn1Q8K2Q9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Shtn1Q8K2Q9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shtn1Q8K2Q9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shtn1Q8K2Q9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms