Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrit1Q8K099 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrit1Q8K099 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrit1Q8K099 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrit1Q8K099 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrit1Q8K099 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrit1Q8K099 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrit1Q8K099 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrit1Q8K099 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrit1Q8K099 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrit1Q8K099 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrit1Q8K099 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrit1Q8K099 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrit1Q8K099 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrit1Q8K099 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrit1Q8K099 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms