Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4f1Q8CCE9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4f1Q8CCE9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms