Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.64
Ccdc30Q8BVF4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc30Q8BVF4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms