Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.6Q85ZW5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.6Q85ZW5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.6Q85ZW5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.6Q85ZW5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.6Q85ZW5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.6Q85ZW5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.6Q85ZW5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.6Q85ZW5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.6Q85ZW5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.6Q85ZW5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.6Q85ZW5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.6Q85ZW5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.6Q85ZW5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.6Q85ZW5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.6Q85ZW5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.6Q85ZW5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.6Q85ZW5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.6Q85ZW5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.6Q85ZW5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.6Q85ZW5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.6Q85ZW5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.6Q85ZW5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.6Q85ZW5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M10.6Q85ZW5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms