Protein–RNA interactions for Protein: Q810F0

Prima1, Proline-rich membrane anchor 1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prima1Q810F0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prima1Q810F0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prima1Q810F0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms