Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup214Q80U93 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms