Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Neil2Q6R2P8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms