Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrn2Q6PHP6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrn2Q6PHP6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms