Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ecm29Q6PDI5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecm29Q6PDI5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms