Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NipblQ6KCD5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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NipblQ6KCD5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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NipblQ6KCD5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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NipblQ6KCD5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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NipblQ6KCD5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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NipblQ6KCD5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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NipblQ6KCD5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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NipblQ6KCD5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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NipblQ6KCD5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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NipblQ6KCD5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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NipblQ6KCD5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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NipblQ6KCD5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NipblQ6KCD5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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