Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mre11Q61216 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mre11Q61216 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms