Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf3Q60803 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Traf3Q60803 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.3 ms