Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SynrgQ5SV85 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SynrgQ5SV85 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SynrgQ5SV85 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynrgQ5SV85 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SynrgQ5SV85 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 215.7 ms