Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc88aQ5SNZ0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms