Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc1Q5NCF2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms