Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam228bQ497Q6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms