Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms