Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctu2Q3U308 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctu2Q3U308 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms