Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CiartQ3TQ03 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms