Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc10Q3TLI0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc10Q3TLI0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms