Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zfp444Q3TDV8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zfp444Q3TDV8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Zfp444Q3TDV8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zfp444Q3TDV8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zfp444Q3TDV8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Zfp444Q3TDV8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zfp444Q3TDV8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zfp444Q3TDV8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zfp444Q3TDV8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Zfp444Q3TDV8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Zfp444Q3TDV8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Zfp444Q3TDV8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Zfp444Q3TDV8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zfp444Q3TDV8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms