Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Specc1lQ2KN98 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Specc1lQ2KN98 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms