Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vmn1r236Q05A06 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms