Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bop1P97452 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bop1P97452 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bop1P97452 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bop1P97452 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bop1P97452 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bop1P97452 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bop1P97452 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bop1P97452 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms