Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RptnP97347 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RptnP97347 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RptnP97347 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RptnP97347 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RptnP97347 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RptnP97347 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RptnP97347 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RptnP97347 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RptnP97347 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RptnP97347 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RptnP97347 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RptnP97347 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RptnP97347 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RptnP97347 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RptnP97347 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RptnP97347 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RptnP97347 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RptnP97347 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RptnP97347 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RptnP97347 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RptnP97347 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RptnP97347 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RptnP97347 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RptnP97347 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RptnP97347 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RptnP97347 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RptnP97347 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RptnP97347 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RptnP97347 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RptnP97347 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RptnP97347 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RptnP97347 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RptnP97347 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RptnP97347 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RptnP97347 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RptnP97347 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RptnP97347 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RptnP97347 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RptnP97347 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RptnP97347 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RptnP97347 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RptnP97347 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RptnP97347 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RptnP97347 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RptnP97347 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RptnP97347 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RptnP97347 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RptnP97347 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RptnP97347 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RptnP97347 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RptnP97347 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RptnP97347 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RptnP97347 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RptnP97347 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RptnP97347 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RptnP97347 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RptnP97347 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RptnP97347 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RptnP97347 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RptnP97347 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RptnP97347 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RptnP97347 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RptnP97347 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RptnP97347 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RptnP97347 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RptnP97347 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RptnP97347 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RptnP97347 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RptnP97347 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RptnP97347 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RptnP97347 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RptnP97347 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RptnP97347 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RptnP97347 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RptnP97347 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RptnP97347 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RptnP97347 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RptnP97347 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RptnP97347 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RptnP97347 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RptnP97347 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RptnP97347 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RptnP97347 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RptnP97347 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RptnP97347 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RptnP97347 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RptnP97347 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RptnP97347 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RptnP97347 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RptnP97347 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RptnP97347 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RptnP97347 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RptnP97347 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RptnP97347 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RptnP97347 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RptnP97347 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RptnP97347 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RptnP97347 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RptnP97347 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms