Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox2P48432 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox2P48432 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox2P48432 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox2P48432 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox2P48432 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox2P48432 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox2P48432 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms